यूरोपीय, हिस्पैनिक्स और एशियाई लोगों के बीच एक आनुवंशिक अंतर है। यूरोपीय लोगों के विपरीत, अन्य नस्लें दूध को सहन करने में सक्षम नहीं हो सकती हैं क्योंकि वे बड़े होते हैं। लगभग 20 फीसदी भारतीय लैक्टोज असहिष्णु हैं। इसका मतलब है कि वे दूध के बड़े संस्करणों को पचा नहीं सकते हैं, निश्चित रूप से यूरोपीय देशों में अनुशंसित तीन गिलास एक दिन नहीं। कई लोग एक दिन में 250 मिली (एक गिलास) पचा सकते हैं। किसी भी चीज में सूजन, गैस, ऐंठन और कभी-कभी दस्त होते हैं। जब दूध गुजरता है तो ये लक्षण होते हैं बिना लैक्टोज के बड़ी आंत छोटी आंत में टूट जाती है।

असहिष्णुता आमतौर पर प्राथमिक है – एशियाई और समय से पहले बच्चों में एक आनुवंशिक स्थिति अधिक होने की संभावना है। एंजाइम लैक्टेज का उत्पादन उम्र के साथ तेजी से गिरता है, जिससे असहिष्णुता होती है। माध्यमिक दूध असहिष्णुता कम आम है। यह आंतों के बैक्टीरियल या वायरल संक्रमण, क्रोहन रोग या कैंसर के उपचार के बाद होता है। दूध के अंतर्ग्रहण के बाद लक्षण आमतौर पर 30 मिनट से दो घंटे में सेट होते हैं।

दूध असहिष्णुता दूध एलर्जी से अलग है, जो तब होता है जब शरीर दूध प्रोटीन को एक विदेशी पदार्थ के रूप में पहचानता है और इसे इम्युनोग्लोबुलिन बनाता है। किसी भी डेयरी उत्पाद का सेवन करने के कुछ ही मिनटों के भीतर चकत्ते, सूजन और सांस लेने में कठिनाई हो सकती है। यदि लक्षण गंभीर हों तो एंटीथिस्टेमाइंस या एड्रेनालाईन की आवश्यकता हो सकती है। दूध की एलर्जी आमतौर पर बचपन में शुरू होती है लेकिन ज्यादातर बच्चे एलर्जी से बच जाते हैं।

यदि किसी बच्चे को दूध से एलर्जी है, तो दूध और दूध उत्पादों को पूरी तरह से बचा जाना चाहिए। इसका मतलब यह है कि पैकेट वाले भोजन में कैसिइन या लैक्टोज जैसे दूध उत्पाद मौजूद हैं या नहीं, यह देखने के लिए लेबल को ध्यान से पढ़ें। दूध असहिष्णुता से निपटना आसान है। दही और छाछ, जो पचाने में बहुत आसान हैं, दूध के लिए प्रतिस्थापित किया जा सकता है। आमतौर पर कॉफी और चाय में दूध की थोड़ी मात्रा को अच्छी तरह से सहन किया जाता है।पाचन में सहायता के लिए लैक्टोबैसिलस संस्कृतियों और प्रोबायोटिक्स को पाउडर या कैप्सूल के रूप में लिया जा सकता है, यदि लैक्टोज का एक अधिभार असुविधा पैदा करता है।